Después de leer varios Howtos sobre flash en amd64 encontré uno que solucionó mis problemas. Aquí relato como instalar un navegador en linux que soporta flash.
Pasos a realizar:
1.- Descargar e instalar:
http://ftp.es.debian.org/debian/pool/main/i/ia32-libs-gtk/ia32-libs-gtk_1.0_amd64.deb
2.- Añadir a /etc/apt/sources.list
deb http://getswiftfox.com/builds/debian unstable non-fre
3.- Instalar Swiftfox
aptitude install swiftfox-athlon64
4.- Instalar el plugin de flash de la página oficial de adobe.
Swiftfox es una versión de firefox compilada para 64bit que soporta los plugins de 32bit.
Un Saludo